Основными направлениями деятельности НОЦ «Институт инноваций в образовании» ТГУ являются: подготовка экспертов в области инновационного образования, экспертное сопровождение проектов по развитию образования, предоставление услуг по повышению квалификации и профессиональной переподготовке в области инновационного образования.

Свое 5-летие научно-образовательный центр отметил проведением конференции «Традиционные и инновационные процессы в образовании: инновационное содержание элитного образования». В рамках конференции 20 ноября состоялась выставка – презентация инновационных разработок НОЦ «Институт инноваций в образовании» и сети образовательных учреждений – лабораторий инновационного образования и экспериментальных площадок ТГУ.
21 ноября прошло торжественное заседание, посвященное подведению итогов пятилетней деятельности «Института инноваций в образовании» НОЦ ТГУ. На торжественном мероприятии состоялась презентация НОЦ «Институт инноваций в образовании» ТГУ, где были представлены основные проекты института и подведены итоги пятилетней работы.
За пять лет работы специалистами «Института инноваций в образовании» были успешно разработаны и выведены на рынок образовательных услуг 16 программ повышения квалификации для специалистов общего и профессионального образования, а представители профессорско-преподавательского состава инновационных вузов из 16 регионов РФ повысили свою квалификацию в рамках программ НОЦа. Реализованы государственные контракты на подготовку молодежных команд для бизнес-инкубаторов. В 2008-2009 годах специалисты НОЦ «Институт инноваций в образовании» и представители лабораторий инновационного образования ТГУ реализуют программу подготовки школьных стратегических команд в рамках комплексного проекта модернизации образования для 98 образовательных учреждений. Заказчики программ Института инноваций в образовании – это органы управления образованием Томской, Кемеровской области и Ханты-Мансийского автономного округа. А также инновационные вузы Тюменской области, Алтайского края и Дальнего Востока.