Ученый-ботаник ТГУ создал уникальную программу для классификации флоры и растительности

Такого в диссертационном совете по ботанике, зоологии и почвоведению не помнят давно. На защиту кандидатской работы старшего преподавателя кафедры ботаники А.А. Зверева в Томск приехали ученые из Новосибирска, Иркутска, Барнаула, Кемерова и других городов. Было прислано более 30 отзывов, и все – с поддержкой диссертанта.

Два в одном

Работа, вызвавшая такой небывалый интерес, действительно отличалась от традиционных диссертаций по этим направлениям наук. Основной акцент в ней делался на программно-информационное обеспечение ботанических исследований. Созданием интегрированной ботанической информационной системы (IBIS) Андрей Анатольевич занимается уже больше 15 лет.
– Так получилось, что одновременно с учебой на БПФ я изучал информатику. Это была первая группа студентов разных курсов, получавшая дополнительное образование под эгидой учебно-научного комплекса «Информатика». Два с половиной года мы учились программированию, созданию баз данных и многому другому. Это все и пригодилось мне в дальнейшем, за что я очень благодарен своим учителям – А.М.Бабанову, Ю.Л.Костюку, В.П.Леонову, а также Б.А.Гладких.
После окончания в 90-м году университета Андрей Анатольевич поступает в аспирантуру, успешно ее заканчивает, но… без защиты кандидатской. «Я уже тогда слишком увлекся работой по созданию программы», – объясняет он.
Труд ботаников по классификации растительных сообществ всегда был тяжелым. Для этой цели в свое время использовались листы миллиметровки очень большого размера, где по вертикали располагались описания, по горизонтали – виды, а на пересечении – их обилия. При классифицировании столбцы и строчки постоянно разрезались и переклеивались. Это труд, который иногда длился годами.
С появлением компьютеров работа ботаников упростилась не намного. Конечно, попытки создать новый инструмент для работы предпринимались не раз, но программы были несовершенны, сильно ограничены в возможностях. Лишь одна из них – TurboVEG, разработанная голландским ученым-ботаником Стефаном Хеннекенсом, была на должном уровне. Но созданная в рамках западной ботанической школы, она не учитывала особенности школы русской.
– Успех моей программы, наверное, и состоит в том, что я перенес на компьютерную основу традиционные технологии работы наших ботаников, – считает А.А.Зверев. – Людям не надо было перестраивать свой способ мышления, просто они получали гораздо более мощный инструмент для классификации. Программа может импортировать данные из других источников и выдавать файлы во внешние форматы, что позволяет произвести практически любую обработку.
А еще удачной она получилась потому, что ее создавал не просто программист, а ботаник, потребности своей науки он понимал как никто другой.

Продолжение следует…

В 1993 году Андрей Анатольевич знакомится с профессором Б.А. Юрцевым, заведующим лабораторией Ботанического института РАН в Санкт-Петербурге. Тот заинтересовался идеей молодого ученого и предложил работу над совместным проектом, который был посвящен долговременному мониторингу флоры азиатской Арктики. Задачей А.А. Зверева было создать базу данных на основе результатов исследований ученых института и разработать инструмент обработки этих данных. Итогом этого многолетнего сотрудничества стали статьи в различных журналах, выступления на конференциях, гранты РФФИ, но главное – за эти годы методы программы все более совершенствовались. «Я постоянно адаптировал программу под запросы, которые к ней предъявляли пользователи, и она приобретала все больше возможностей».
Ученые разных городов узнавали о IBIS, просили автора установить им программу. Сегодня около 20 организаций нашей страны пользуются IBIS, на ее основе защищено 8 докторских и 21 кандидатская, и для каждой из этих работ автор модифицировал свой продукт. Только сам «сапожник оставался без сапог». Но зато сейчас появились оптимальные условия для защиты, считает Андрей Анатольевич. Во-первых, сама программа наконец-то обрела некую законченную форму, во-вторых, появились специалисты, способные оценить эту работу. Ведь тема диссертации оказалась, по сути, на стыке наук и ботаническая составляющая в ней скорее как иллюстрация новых методов анализа, классификации данных с использованием компьютера. В прежние времена такая работа могла вызвать непонимание и даже неприятие.
Не успела состояться защита, а Андрей Анатольевич уже снова погрузился в работу.
– Надо «раздать долги», которые накопились, пока я писал диссертацию, – шутит он. – Уже есть заказы на создание новых инструментов в рамках IBIS. Например, с сотрудниками Центрального сибирского ботанического сада в Новосибирске мы заканчиваем разработку полного инструментария работы с экологическими шкалами, которые позволят индицировать по растительности условия окружающей среды. Это методика известна, но пока в «ручном варианте». То есть программа развивается дальше, и ее совершенствованию, наверное, нет предела.
И все-таки Андрей Анатольевич считает себя больше ботаником, чем программистом, активно участвует в полевых экспедициях, занимается научными исследованиями. Но двойное образование помогло создать уникальный продукт, которым теперь пользуются сотни людей.

Наталья ШАРАПОВА
Фото Анны СЫРЕНКОВОЙ